כאשר משתמשים ביותר מתרופה אחת, עלול להיווצר מצב של אינטראקציה בין תרופתית, מה שנכון גם במקרה של קנאביס רפואי. מומלץ להתייעץ עם הרופא המטפל לפני תחילת הטיפול בקנאביס, ולבחון האם קיימות תגובות הדדיות שניתן לצפות להן בין הקנאביס לבין התרופה שנוטל המטופל. כמו כן, במהלך הטיפול בקנאביס חשוב לעקוב באופן שוטף אחר מצבו של המטופל ולוודא שהטיפול התרופתי נשאר מאוזן גם בשימוש בקנאביס.